Arrivé au club de l’Universidad Católica à ses neufs ans, Guillermo Maripán remporte le championnat d’ouverture et de clôture en 2016 du Chili avec son club formateur. À l’été 2017, il rejoint la Liga et le club d’Alavés (Espagne). Lors des deux dernières saisons, le défenseur central dispute 47 matches sous les couleurs du club espagnol. Demi-finaliste de la Copa America 2019, le natif de Vitacura est transféré le 24 Août 2019 à l’AS Monaco pour cinq saisons.